Umożliwia sekwencjonowanie materiału genetycznego pochodzącego od dowolnego organizmu w technologii długich odczytów. Przewagą sekwencjonowania nanoporowego jest brak konieczności zwiększenia liczby kopii danego genu, czyli amplifikacji, dzięki czemu sekwencjonowane są natywne cząsteczki DNA. Dzięki zastosowaniu technologii długich odczytów możemy z powodzeniem analizować: warianty strukturalne, translokacje chromosomowe, haplotypy i geny fuzyjne. Ponadto sekwencjonowanie natywnych cząsteczek DNA sprawdza się w badaniach epigenetycznych pozwalając ocenić poziom metylacji całego genomu.
Możliwe jest sekwencjonowanie izolatów DNA, jak również zamówienie wykonania izolacji z dostarczonego materiału biologicznego (po konsultacji).
Sekwencjonować można:
- genomy wirusowe dsDNA;
- genomy bakteryjne;
- genomy grzybowe;
- małe i duże genomy eukariotyczne.
Usługa obejmuje wykonanie sekwencjonowania materiału genetycznego na platformie GridION lub PromethION (w zależności od zapotrzebowania na dane), oraz podstawowe etapy przetwarzania danych: rozbarkodowanie i filtrowanie danych (tj. usuwanie sekwencji adaptorowych oraz odczytów o słabej jakości), a także utworzenie raportu statystyk z przeprowadzonego sekwencjonowania.
Wyniki analizy przekazywane są w formie plików .fastq lub .fast5.
W przypadku zainteresowania usługą prosimy o kontakt pod adresem email: bok@genxone.eu. Dokładna oferta zostanie przygotowana w oparciu o ustalone szczegóły analizy.