Odczytanie pełnej sekwencji genomów koronawirusa SARS-CoV-2  stało się naturalną konsekwencją w efektywnej walce z trwającą epidemią. Takich informacji dostarczają analizy sekwencjonowania, jednak najczęściej nie są one ogólnodostępne dla osób indywidualnych. Jak zatem dowiedzieć się czy zaatakował nas jeden z niebezpiecznych wariantów koronawirusa? Na to pytanie odpowiadamy w poniższym artykule.

Szybkie rozpoznanie mutacji koronawirusa

genXone w swoim laboratorium wykorzystuje udoskonalony test Real-Time PCR na koronawirusa. Wskazuje on nie tylko samo zarażenie wirusem, ale także dostarcza informację czy zidentyfikowany koronawirus posiada w swoim kodzie genetycznym mutacje charakterystyczne dla wariantów uznanych za niebezpieczne. Oznacza to, że wykonując badanie od razu dowiadujemy się czy jesteśmy zarażeni oraz czy zidentyfikowany w naszym wymazie koronawirus posiada mutacje charakterystyczne dla niebezpiecznych wariantów. Szczegółowa oferta badania jest dostępna TUTAJ.

Test PCR identyfikujący mutację wirusa – jak to działa?

Opisany powyżej test jednocześnie wykrywa sekwencje 4 genów koronawirusa SARS-CoV-2  (E, N, S/RdRP), a także 5 mutacji w białku S, które są charakterystyczne dla wariantów tak zwanych znaczących. Po uzyskaniu pozytywnego wyniku w obu przypadkach, możliwe jest konkretne rozróżnienie wariantów znaczących koronawirusa. W tym celu wykonywany jest kolejne badanie, jednak na podstawie tej samej pobranej próbki, które wykrywa znaczące mutacje w sekwencji genu S (E484K, N501Y, delecja HV 69/70). Na tej na podstawie możliwe jest rozróżnienie wariantów znaczących koronawirusa.

Interpretacja badania jest więc następująca:

– wykrycie zmiany HV 69/70 oznacza identyfikację mutacji charakterystycznej dla brytyjskiego wariantu koronawirusa (B.1.1.7);
– wykrycie zmiany N501Y oznacza identyfikację mutacji charakterystycznej dla południowoafrykańskiego wariantu koronawirusa (B.1.1.7 | B.1.351 | P.1);
– wykrycie zmiany E484K oznacza identyfikację mutacji charakterystycznej dla brazylijskiego i/lub nigeryjskiego wariantu koronawirusa (B.1.351 |P.1 | P.2 | B.1.525).

Technika Real-Time PCR

Stosowana w badaniach technika Real-Time PCR to metoda polegająca na powieleniu unikalnych fragmentów DNA charakterystycznych dla konkretnych patogenów, a następnie wykryciu ich materiału genetycznego. Charakteryzująca ją wysoka czułość umożliwia identyfikację czynników chorobotwórczych nawet na bardzo wczesnym etapie rozwoju choroby. Trafna i szybka diagnostyka zakażeń wirusowych w chorobach infekcyjnych pozwala podjąć decyzję o właściwym sposobie leczenia chorego. Więcej o samej metodzie Real-Time PCR TUTAJ.