fbpx

Sekwencjonowanie całogenomowe

SEKWENCJONOWANIE CAŁOGENOMOWE

Umożliwia sekwencjonowanie materiału genetycznego pochodzącego od dowolnego organizmu w technologii długich odczytów. Przewagą sekwencjonowania nanoporowego jest brak konieczności zwiększenia liczby kopii danego genu, czyli amplifikacji, dzięki czemu sekwencjonowane są natywne cząsteczki DNA. Dzięki zastosowaniu technologii długich odczytów możemy z powodzeniem analizować: warianty strukturalne, translokacje chromosomowe, haplotypy i geny fuzyjne. Ponadto sekwencjonowanie natywnych cząsteczek DNA sprawdza się w badaniach epigenetycznych pozwalając ocenić poziom metylacji całego genomu.

Możliwe jest sekwencjonowanie izolatów DNA, jak również zamówienie wykonania izolacji z dostarczonego materiału biologicznego (po konsultacji).

Sekwencjonować można:

  • genomy wirusowe dsDNA;
  • genomy bakteryjne;
  • genomy grzybowe;
  • małe i duże genomy eukariotyczne.

Usługa obejmuje wykonanie sekwencjonowania materiału genetycznego na platformie GridION lub PromethION (w zależności od zapotrzebowania na dane), oraz podstawowe etapy przetwarzania danych: rozbarkodowanie i filtrowanie danych (tj. usuwanie sekwencji adaptorowych oraz odczytów o słabej jakości), a także utworzenie raportu statystyk z przeprowadzonego sekwencjonowania.

Wyniki analizy przekazywane są w formie plików .fastq lub .fast5.

W przypadku zainteresowania usługą prosimy o kontakt pod adresem email: office@genxone.eu. Dokładna oferta zostanie przygotowana w oparciu o ustalone szczegóły analizy.